Ho scritto all'autore di metapad e resto in scettica attesa. Tuttavia a rinforzare il sospetto che trattasi di colore di sistema e non di questo o quel software è la faq 27 a pag.
http://liquidninja.com/metapad/faq.html, che seppur non riferita nello specifico a Win98SE trascrivo per comodità:
Q: Can you change the color of the hyperlinks (in the full version)?
A: Some versions of Windows allow this. For Windows 7, go to Control Panel\Appearance and Personalization\Personalization\Window Color and Appearance then select Advanced Appearance Settings and the item called Hyperlink will allow you to change the color.