Non hai specificato come è messo il PC: quanti HD e come partizionati, se hai possibilità (spazio sul disco di sistema) di aggiungere una partizione per installare una copia del sistema operativo, ecc.
Alla fine la soluzione più semplice per risolvere il tuo problema è creare una partizione NTFS vuota sul disco di avvio e installare qui una seconda copia dello stesso sistema operativo che hai, creare (se esiste e se ne hai possibilità) una partizione di lavoro su un altro disco NON di sistema (ma se non hai un secondo HD almeno crea una partizione di lavoro dedicata) e qui trasferire tutti i tuoi "lavori in corso" (serve ad evitare che se "domani" avrai bisogno di riformattare, ti debba ritrovare il problema dei "lavori in corso"... in questo modo se formatti e reinstalli il S.O. ritrovi tutto come era... li che ti stà aspettando...
).
Una volta che avrai fatto la seconda installazione + la partizione di lavoro (ripeto, possibilmente su un altro disco) e reso il secondo sistema completamente operativo per i tuoi scopi, reinstalli il primo e usi questo per tutto il resto (anche le minch...) e quello secondario SOLO per le cose importanti, sempre e solo OFFLINE.
La ricetta "...prevenire è meglio che curare..." vale per tutto...
Su come si fa il ripartizionamento dei dischi ecc. trovi tutto sulla rete e sicuramente persone qui che ti possono aiutare, questa è solo una traccia di massima.
Auguri!